В 1887 году было построено здание, отведенное под музей. Все экспонатные коллекции музея разделили на 5 частей: этнографический, промышленный, исторический, образовательный и археологический.

В 1895 году опубликовались каталоги по всем коллекциям музея. В основном коллекциями музея становились экспонаты с частных пожертвований, но уже с 1910 года музей начинает заниматься организацией экспедиций в Тобольскую губернию.

В 1890 году все коллекции передали Тобольскому обществу Губернского музея. Обществом был принят Устав, основной направленностью которого являлось знакомство публики с историей и развитием культуры Тобольской губернии.

В 1891 году Царевич Николай Александрович взял музей под свое покровительство. Тобольский краеведческий музей широко известен в России и за ее пределами.

Адрес: 626150, город Тобольск, Красная площадь, 5