Музей истории Томска расположен в здании постройки 1859 года. Он был основан в 1997 году, но для посетителей открылся только 7 июня 2003 года. Открытие музея было отмечено постоянной выставкой «Портрет старого Томска». Кроме нее в музее можно посетить экспозицию «Первый век Томска», на которой представлены уникальные экспонаты XVII века, а так же достоверные реконструкции предметов быта и городской жизни Томска того периода. Здесь собран богатый иллюстративный и текстовый материал, раскрывающий темы освоения Сибири, основание города Томска, а так же быта и занятий томичей в период с XVII по XIX век. В рамках музея действует постоянная экспозиция «Русская изба XIX-XX вв.», «План-панорама города Томска первой четверти XX века».

В залах музея регулярно проходят временные исторические, этнографические и художественные выставки, имеющие отношение к городу. При музее истории Томска действует специальная программа для детей дошкольного и школьного возраста, позволяющая познакомиться с историей родного города. Для этого сотрудниками музея организуются не только экскурсии по залам музея, но и прогулки по городу с посещением его исторических мест. В музее имеется своеобразная смотровая площадка, расположенная в бывшей пожарной каланче. Это самая высокая на сегодняшний момент обустроенная видовая точка города. На ней в память о прежних временах в 2006 году был установлен манекен пожарного Афанасия.

Адрес: Томск, ул. Бакунина, 3